水生生物学专业早期以研究水生生物的形态、分类和自然生态为主;其后由于个体生态和种群生态研究的开展，生理学、生物化学概念和方法的引入，特别是1935年，英国科学家A.G.坦斯利提出“生态系统”概念以后，水生生物学也有了较完整的“水生态系统”概念。

全国共有20所招收水生生物学专业研究生的学校参与了排名，其中排名的是中山大学，排名第二的是厦门大学，排名第三的是暨南大学，以下是水生生物学专业考研学校排名具体名单：