南京中医药大学招生专业有伤寒学、中医诊断学、临床中药学、中西医结合基础 、中医痹病学、中医肿瘤学、中医骨伤科学、中医耳鼻喉科学、中医养生学、推拿学、中药药剂学、中药化学等，具体更多完整招生专业请看下表。

南京中医药大学招生专业一览表

南京中医药大学重点专业名单

1、国家级专业（5个）：中医学、中药学、针灸推拿学、中药资源与开发、护理学

2、世界一流学科建设学科（1个）：中药学

3、国家重点学科（3个）：中药学、中医医史文献、中医儿科学

4、国家重点（培育）学科（2个）：中医学、中医内科学

5、国家中医药管理局“十一五”重点学科（14个）：方剂学、温病学、中医儿科学、中医妇科学、中医肝胆病学、针灸学、药用植物学、中药药理学、中药炮制学、中医医史文献学、中医护理学、中医脾胃病学、中医肾病学、中医肛肠病学

6、国家中医药管理局“十二五”重点学科（19个）：伤寒学、中医诊断学、临床中药学、中西医结合基础 、中医痹病学、中医肿瘤学、中医骨伤科学、中医耳鼻喉科学、中医养生学、推拿学、中药药剂学、中药化学、中药资源化学、中医药信息学、中医文化学、中医药管理学、中医皮肤病学、中西医结合临床、中医心病学

7、江苏省重点学科（8个）：中医临床基础、方剂学、中医诊断学、中医内科学、中医外科、中医妇科、针灸推拿学