吉林省最好的理科大学是吉林大学，也是省内最好的文科大学、最好的综合性大学，全国理科综合实力排名十四位。
另外值得一提的是东北师范大学，理学全国第十几位。东北电力大学的水利、水电是全多著名的，全国电力大学老二。

还有延边大学、长春理工大学、长春工业大学、长春农业大学的理科也还可以。

说明：
大学理科（自然科学）是理学、工学、农学、医学4个学科的统称，也就是每年高考中的理科。
理学包括数学、物理学、化学、生物科学、天文学、地质学、地理科学、地球物理学、大气科学、海洋科学、力学、电子信息科学、材料科学、环境科学、心理学、统计学等16个学科类，共有31个本科专业。
工学包括地矿、材料、机械、仪器仪表、能源动力、电气信息、土建、水利、测绘、环境与安全、化工与制药、交通运输、海洋工程、轻工纺织食品、航空航天、武器、工程力学、生物工程、农业工程、林业工程、公安技术等21个学科类，共有79个本科专业。
农学包括植物生产、草业科学、森林资源、环境生态、动物生产、动物医学、水产等7个学科类，共有16个本科专业。
医学包括基础医学、预防医学、临床医学与医学技术、口腔医学、中医学、法医学、护理学、药学等8个学科类，共有16个本科专业。