南京农业大学2013届毕业生共计6514人，其中本科生4102人，硕士生1896人，博士生516人，毕业生总人数较上年增加408人，合计增幅6.7%，其中研究生增幅11%，本科生增幅4.7%。

截至2013年底，按照教育部就业率统计口径，我校2013届毕业生年终就业率为97.10%，其中，本科生年终就业率为97.46%，硕士生年终就业率为95.73%，博士生年终就业率为99.22%。本科毕业生直接就业比例为66.94%，其中签约就业率64.43%、灵活就业率2.51%；另有30.52%的本科毕业生选择继续深造，其中国内升学比例25.60%、国外留学比例4.92%。硕士生以直接就业为主，就业率达79.59%，另有16.14%的硕士毕业生选择继续深造，其中有14.45%的学生选择在国内继续深造。博士生直接就业率98.26%，少部分人出国继续深造。