学院具有独立法人地位，实行董事会领导下的院长负责制，设有独立财务；学院设有党委，下设6个党总支，41个党支部；机构设置实行三级设置两级管理，即设学院、学科部、系三级，学院、学科部两级管理，系无行政职能。学院设有5大学科部、14个党政机构及5个业务单位（具体详见附件一）。

学院建院十余年，已为社会输送八届共计15057名毕业生，一次性就业率均达84%以上。2005年至2010年，学院就业率连续六年位居全省独立学院首位，人才培养质量获得社会好评。学院在全国大学生数学建模竞赛、CCTV杯全国大学生英语竞赛、全国电子设计大赛等各类比赛中获得各种奖励850个，其中：国家级奖356个，省级奖494个，并先后荣获“改革开放30年中国十大品牌独立学院”、“全国十佳独立学院”和“江西省规范管理年先进单位”、“江西省创新发展年先进集体”、“全省大学生政治教育工作先进集体”、“江西省2007～2009年就业工作先进单位”、“全省教育系统人事人才工作先进集体”等多项荣誉。学院的办学事迹多次被《瞭望》、《中国教育报》、江西教育电视台等多家媒体宣传报道。学院良好的社会形象和品牌效应已经形成。

南昌大学科技学院机构设置情况表