没有区别。都是国家教育部认可、颁发并承认的学历证明，换言之，高校毕业证就是只有专科、本科、硕士研究生或者博士研究生等学历之分，而从毕业证上并无体现民办大学还是公办大学之区分!

一、所有民办高校的学历证书国家都不承认？

不是所有民办高校的学历证书国家都不承认。

第一种：民办高校招生列入国家招生计划、通过省招办录取或备案。此类招生计划可通过阳光高考信息台查询，也可以通过省市招办印制的高校招生专业目录或发给学生的报考资料查询学校公布的专业和人数。

第二种：民办高校计划外招生，组织学生参加高自考，各门考试及格，可获得国家承认学历的自学考试毕业证书;其自考学历可在教育部指定的学历查询网站上查询。

第三种：民办高校计划外招生，学校自行颁发的毕业证书，属于學習或培训的经历记载，国家不承认学历。

二、独立学院和民办学院有哪些不同

独立学院是本科，而民办学院是本科、专科都有。独立学院是按照教育部行政规章设立的，而民办学院是按照民办教育促进法设立的。

民办学院有自己的校名、组织机构、师资力量和自己独立颁发的毕业证书。但是独立学院一般都是在某个大学名下设立的。可能会和挂名大学在同一个校园，也可能在师资量方面有共享，这是民办学院没有的优势。

独立学院毕业时，如果成绩好的学生可以推荐使用挂名院校的毕业证书，但是毕业证书上可能会略有差别。但是民办学院会有自己的毕业证书。

独立学院因为不是公办院校，所以一般学费都会比较贵，基本学费都在一万以上，独立院校大多是在本科三批招生，但是现在在很多省市都合并到本科二批招生了

三、独立学院与民办学院的区别

1.民办高校是按照民办教育促进法设立的，而独立学院是教育部行政规章设立的。独立学院一定是本科，而民办高校专本科都有。
2.独立学院的举办方一定是普通高校，合作方是社会力量，而民办则只有社会力量作为举办者，这是区分两者的最简单的一点。
3.民办就是有自己的校名，自己组织机构，自己的师资，自己的校园，自己独立颁发毕业证书。
4.独立学院一般设在某个大学名下。比如山西大学商务学院，海南大学三亚学院等，这些学院，可能和挂名的大学同在一个校园，也可能有师资等方面的共享和交流，而民办学院没有这方面的优势。
两者都是企业法人性质，有独立的财政体系，自付盈亏，处于全部自费状态。