独立学院的毕业证和本校通常是不一样的。

独立学院具有独立的校园和基本的办学设施，实施相对独立的教学组织和管理，独立进行招生，独立颁发学历学位证书，具有独立法人资格，基本相当于一个独立的学校。

独立学院的毕业证书上盖的章是独立学院的章，而学校本部的学生毕业证上的章则是学校本部的印章。例如，厦门大学嘉庚学院的毕业生获得的是学院独立颁发的学历和学位证书。

不过，也有一些特殊情况。例如，部分由学校本部与地方政府合作开办的“分校”，在各类学历学位证书方面实现了与本部完全一致，如山东大学威海分校。

需要注意的是，具体的毕业证情况可能因学校的规定和政策而有所不同。在报考学校时，建议详细了解该校的相关政策以及毕业证的颁发方式。同时，无论毕业于哪类院校，个人的能力和综合素质在就业和未来发展中都起着重要的作用。