独立院校的毕业证与本校（母体学校）有以下不同：

一、院校名称

1. 独立院校：毕业证上的院校名称为独立院校全称，如 ×× 大学 ×× 学院。例如，厦门大学嘉庚学院的毕业证上显示的是 “厦门大学嘉庚学院”。

2. 本校：毕业证上显示的是本校的名称，即母体学校的全称，如 ×× 大学。例如，厦门大学的毕业证上显示的是 “厦门大学”。

二、印章

1. 独立院校：毕业证上一般盖独立院校的印章，可能同时还会有独立院校校长的签名。例如，北京师范大学珠海分校的毕业证上盖的是 “北京师范大学珠海分校” 的印章。

2. 本校：盖本校的印章，以及本校校长的签名。例如，北京师范大学的毕业证上盖的是 “北京师范大学” 的印章。

三、含金量及社会认可度

1. 独立院校：一般来说，独立院校的社会认可度和毕业证的含金量相对本校会低一些。独立院校成立时间相对较短，在师资、教学资源、学科建设等方面与本校可能存在一定差距。不过，一些优秀的独立院校在某些专业领域也有不错的表现。

2. 本校：本校通常具有更悠久的历史、更雄厚的师资力量、更丰富的教学资源和更高的学术声誉，其毕业证在就业、升学等方面往往更具优势。例如，在一些用人单位招聘时，可能会对本校毕业生给予更高的关注度和优先考虑。

总体而言，独立院校的毕业证与本校在院校名称、印章以及社会认可度等方面存在明显差异。考生在报考时应充分了解独立院校与本校的区别，根据自己的实际情况做出合理选择。