级学科、53个二级学科具有硕士学位授予权。
“十一五”期间，学校共承担国家级、省部级科技计划项目1050项，学科建设与科研总经费1.5亿元；在国际性和国家级期刊发表科研论文3700余篇，其中SCI收录论文347篇；出版教材著作648部；获省部级科技奖励142项，获专利授权62项。
直属附属医院中，第一医院、第二医院是山西省规模最大的综合性三级甲等医院，全国百姓放心医院，共开放床位2473张，技术力量雄厚，医疗水领先；口腔医院是省内唯一一所三级乙等口腔专科医院，拥有日本森田3D牙科CT机、德国西门子数字化全景机等一批先进医疗设备，开放牙科综合治疗椅76台。
学校与美国、日本、德国、意大利、澳大利亚、香港、台湾等国家和地区多所院校建立了教育、科技、医疗合作关系。
经过九十多年的薪火相传，经过几代人的艰辛拼搏，山西医科大学取得了辉煌的成就。在未来的征程中，学校将继承优良办学传统，加快发展步伐，为建成建好鲜明的教学研究型医科大学而努力奋斗。