云南大学是双一流大学。1978年云南大学被国务院确定为全国88所重点大学之一，1996年首批列入国家“211工程”重点建设大学，2001年列入西部大开发重点建设院校，2017年成为中国首批42所“一流大学”建设高校之一，2018年跻身于中西部14所“以部为主、部省合建”高校行列。

云南大学下设26个学院、10个研究机构、2个独立学院，1个附属医院，设有研究生院。

云南大学有本科专业79个，17个本科专业入选国家“双万”计划，13个专业入选省“双万”计划，有12个国家专业，6个专业“菁英班”，10个专业“卓越班”，3门“国家精品在线开放课程”；有21个一级学科博士学位授权，42个一级学科硕士学位授权，22个专业硕士学位授权。

在教育部第四轮学科评估中，学校有30个学科进入全国前70%，其中，A类学科2个（民族学为A+，生态学为A-），B类学科14个。化学、植物学与动物学学科进入全球ESI前1%。